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深圳9游总区生物报道:中山大学李陈龙教授课题组正式发表了题为“Verification of DNA Motifs in Arabidopsis using CRISPR/Cas9 Mediated Mutagenesis”的研究论文,报道了采用CRISPR/Cas9技术在植物体内验证由染色体免疫沉淀结合下一代测序获得的DNA基序。
这一研究成果公布在植物学一区杂志Plant Biotechnology Journal(IF=6.25)上,中山大学李陈龙教授为论文第一作者和通讯作者,中山大学是第一完成单位,来自加拿大农业部的陈琛博士为论文共同第一作者。研究受到青年千人计划项目的支持。
转录因子和染色体修饰蛋白通过识别特异的DNA基序来实现它们对靶标染色体的结合。染色体免疫沉淀结合下一代测序(ChIP-seq)已经被广泛用于发掘潜在的被转录因子和染色体修饰蛋白识别的DNA基序。然而,在植物体内验证这些DNA基序的方法一直缺乏。
在这项研究中,研究人员采用CRISPR/Cas9技术特异的删除或修改前期发现的组蛋白H3K27去甲基化酶REF6的识别基序CTCTGYTY。研究人员发现当这个基序被从内源靶基因删除后,REF6不能正确的结合在靶基因上,因此从体内证明了该基序确实是REF6识别靶基因必不可少的元件。研究人员认为该CRISPR/Cas9技术应该能广泛应用于体内验证由ChIP-seq所发现的DNA基序。
原文标题:
Verification of DNA Motifs in Arabidopsis using CRISPR/Cas9 Mediated Mutagenesis
0755-28715175/33164177